菠萝蛋白酶是一种水溶性酶，通常在水溶液中表现出良好的稳定性。它的活性受温度、pH值和离子强度等因素的影响较大。菠萝蛋白酶的活性温度一般在50-60摄氏度之间，pH值则一般在4.5至8.0之间最为理想。超过一定温度或pH条件下，酶活性会降低。产品用途

1、焙烤食品：将菠萝蛋白酶加入生面团中，可使面筋降解，生面团被软化后易于加工。并能提高饼干与面包的口感与品质。

2、干酪：用于干酪素的凝结。

3、肉类的嫩化：菠萝蛋白酶将肉类蛋白质的大分子蛋白质水解为易吸收的小分子氨基酸和蛋白质。可广泛地应用于肉制品的精加工。

4、菠萝蛋白酶在其它食品加工业中的应用，有人已经用菠萝蛋白酶来增加豆饼和豆粉的PDI值和NSI值，从而生产出可溶性蛋白制品及含豆粉的早餐、谷类食物和饮料。其它还有生产脱水豆类、婴儿食品和人造黄油；澄清苹果汁；制造软糖；提供可消化的食品；给日常食品添味等。